農(nóng)藥殘留微生物降解技術是南京農(nóng)業(yè)大學李順鵬教授領導的研究團隊首創(chuàng)的具有自主知識產(chǎn)權的新型原位生物修復技術。該項目針對農(nóng)產(chǎn)品以及農(nóng)業(yè)生態(tài)環(huán)境中農(nóng)藥殘留嚴重超標、農(nóng)產(chǎn)品市場競爭力下降的嚴重狀況，通過篩選高效農(nóng)藥殘留降解菌株，經(jīng)現(xiàn)代化工業(yè)大規(guī)模發(fā)酵制成菌劑。該菌劑利用微生物所產(chǎn)生的酶類應用于農(nóng)藥殘留的原位生物修復技術，達到清除土壤、水體、農(nóng)產(chǎn)品中有機污染物的目的。該項技術解決了物理、化學處理修復難度大，成本高及二次污染的問題。
　　同時，該項目建立了農(nóng)業(yè)環(huán)境微生物種質(zhì)資源庫，篩選到高效安全降解菌株二十多株。菌株性能優(yōu)越，農(nóng)藥殘留降解率高達95％～99．8％，菌株本身無毒、無害、無二次污染；有機磷降解菌降解甲基對硫磷的效果達100％。同時，構建了能降解有機氯及有機磷和同時降解3種以上有機磷農(nóng)藥的降解菌各1株，能同時高效降解甲基對硫磷和呋喃丹農(nóng)藥的工程菌1株。
　　研究人員還開展了降解菌株的基礎研究，進行了一系列難降解有機化合物代謝途徑與物質(zhì)循環(huán)的研究、降解菌的分子生態(tài)學研究、降解性基因的定位與克隆、降解酶基因的表達與酶學研究、基因工程菌的構建與其環(huán)境釋放安全性評價、工程菌的穩(wěn)定表達與高效表達等研究，建立了一整套有毒難降解有機化合物、微生物降解研究的手段與方法，構筑了全面的技術平臺，研究水平處于國際先進水平。同時，該項目還進行了農(nóng)藥殘留降解菌的生態(tài)學研究，采用發(fā)光酶基因與綠色熒光蛋白（GFP）標記法研究了農(nóng)藥降解菌生態(tài)效應，這一研究接近國際先進水平。
　　該項目與果蔬鮮切技術、檢測技術等配套技術結(jié)合，形成了一套低成本的綠色農(nóng)產(chǎn)品生產(chǎn)加工體系。目前，該技術在稻米、茶葉、早竹筍和蘆筍等無公害農(nóng)產(chǎn)品生產(chǎn)應用中取得了顯著的經(jīng)濟效益和社會效益。